Historia Miedniki Królewskie to jedna z najstarszych miejscowości w rejonie wileńskim. W 1311 r. lub nieco później został tu zbudowany potężny zamek obronny. W 1391 r. w Miednikach został zbudowany jeden z pierwszych kościołów. Zamek był letnią rezydencją księcia Kazimierza Jagiellończyka, mieszkali tu często synowie króla wraz ze swym wychowawcą Janem Długoszem. Uważa się, że tutaj spędził swoje lata młodzieńcze królewicz Kazimierz, później ogłoszony świętym - patronem Polski i Litwy. W 1655 r. w czasie wojny z Rosją zamek został częściowo zburzony. Miedniki także mocno ucierpiały w 1812 r., podczas najazdu cesarza Napoleona I na Rosję. W 1922 r. zostały wyświęcone fundamenty obecnego drewnianego kościoła. Kościół zbudowany w 1931 r., są w nim cenne obrazy, zaliczane do arcydzieł sztuki sakralnej. W 1989 roku na Górze Józefowej został umieszczony pamiątkowy obelisk ku czci litewskiego króla Mendoga. W 1991 roku w pobliżu Miednik bestialsko zamordowano 7 żołnierzy pogranicza i celników litewskich. Przy życiu pozostał tylko celnik Tomas Šernas.