Obecnie kierownikiem i dyrygentem Chóru jest dr hab. Arkadiusz Kaczyński, absolwent Wyższej Szkoły Pedagogicznej w Bydgoszczy (1994) oraz Akademii Muzycznej w Poznaniu (1999), a obecnie na stanowisku Profesora w Katedrze Dyrygentury Instytutu Edukacji Muzycznej Uniwersytetu Kazimierza Wielkiego w Bydgoszczy.
Występy W kwietniu 2005 roku Chór uczestniczył w koncercie „Noc Rosyjska” w Auli Politechniki Warszawskiej, na którym wspólnie z kilkoma warszawskimi chórami akademickimi i Polską Orkiestrą Radiową pod dyr. Łukasza Borowicza wykonano fragmenty z oper Borys Godunow M. Musorgskiego, Kniaź Igor A. Borodina oraz uwerturę Rok 1812 P. Czajkowskiego. Na zakończenie sezonu artystycznego 2005/06 Filharmonii Pomorskiej w Bydgoszczy, wspólnie z Chórami Singakademie Frankfurt n/Oder wykonał Carmina Burana C. Orffa pod dyr. Rudolfa Tierscha. Na inaugurację sezonu artystycznego 2006/7, Chór Akademicki zaproszony ponownie przez Filharmonię Pomorską 15 X 06, wspólnie z bratnim Chórem wydziałowym Tibi Domine, wykonał Wielką Mszę c-moll Mozarta w ramach koncertu Papieskiego pod dyr. Tadeusza Wicherka, za którą oba toruńskie zespoły zebrały pochlebne opinie bydgoskiej krytyki muzycznej.