W XV i XVI wieku Jama miała nie tylko znaczenie militarne, ale także coraz większe znaczenie gospodarcze jako osada rzemieślnicza.
W czasie wojen północnych Wielkie Księstwo Moskiewskie dwukrotnie utraciło twierdzę na rzecz Szwecji: po raz pierwszy w latach 1583–1595, a później na mocy pokoju stołbowskiego w 1617 r. Następnie miejscowość należała do Szwecji przez prawie sto lat, aż do jej utraty w okresie Wielkiej Wojny Północnej, gdy Rosja odbiła miasto w 1703 roku. W czasie okupacji szwedzkiej pozostałości dawnej twierdzy zostały zniszczone, a miejscowości nadano nazwę Jamburg. Nazwa ta funkcjonowała do 1922 roku. Na początku XVIII w. Jamburg należał do księcia Aleksandra Mienszykowa, a później przeszedł pod administrację państwową. W XVIII wieku Jamburg przestał mieć znaczenie militarne, a zamiast tego rozwinął się tu przemysł szklarski. W 1784 roku Jamburg otrzymał prawa miejskie. W XIX wieku przez miasto poprowadzono kolej. Po rewolucji październikowej w 1917 r. i przejęciu władzy przez komunistów, w 1922 r. Jamburg otrzymał obecną nazwę na cześć estońskiego rewolucjonisty Wiktora Kingisseppa.