Toyotomi przystał na ten warunek i zlikwidował fosę, czyniąc zamek prawie bezbronnym.
Latem następnego roku Hideyori nakazał ponowne wykopanie fos. Oburzony Tokugawa wysłał ponownie wojska do zamku Osaka. Armia Tokugawy rozgromiła ludzi Toyotomiego wewnątrz zewnętrznych murów 4 czerwca. Osaka-jō został przejęty przez Tokugawę, a klan Toyotomi ostatecznie upadł. thumb|left|220px|Mury zamku Siogun Hidetada Tokugawa rozpoczął odbudowę i ponowną fortyfikację zamku w roku 1620. Wybudował nową, podwyższoną wieżę główną z pięcioma piętrami na zewnątrz i ośmioma wewnątrz, a budowę murów zlecił konkretnym klanom samurajskim. Mury wybudowane w latach dwudziestych XVII wieku istnieją do dziś. Mury zbudowane są z bloków granitowych, bez użycia zaprawy. Część materiału budowlanego dostarczono z kamieniołomów z wybrzeży japońskiego Morza Wewnętrznego, na wielu blokach znajdują się herby klanów, które dołożyły kamienie do muru. Główna wieża spłonęła od uderzenia piorunu w 1645 roku.
W 1843 roku, po latach zaniedbania, rozpoczęto na zamku prace naprawcze, na które siogunat zbierał pieniądze od ludzi z całego regionu, jednak w 1868 roku znaczna część zamku spłonęła podczas wojny domowej, trwającej w czasie tzw. restauracji Meiji.