Natomiast w rządzie Mariana Zyndrama-Kościałkowskiego został kierownikiem resortu (od 13 października 1935 do 5 grudnia 1935). Funkcję w rządzie przestał pełnić wskutek własnej rezygnacji 05.12.1935 r. Później - choć krótko - ponownie pełnił stanowisko podsekretarza w tym ministerstwie. W 1936 – ze względu na stan zdrowia – zrezygnował z pracy w resorcie.
Po zakończeniu aktywności politycznej Chyliński powrócił do wykładów na UJK, zaangażował się ponownie w prace Polskiego Towarzystwa Filologicznego. W 1938 r. objął funkcję kuratora Akademickiego Stowarzyszenia Przyjaciół Rumunii.
Zmarł 5 lutego 1939 we Lwowie. 8 lutego 1939 został pochowany na Cmentarzu Łyczakowskim we Lwowie, a dzień pogrzebu został ogłoszony dniem żałoby na Uniwersytecie Jana Kazimierza.
Po jego śmierci p.o. kierownika Zakładu Historii Starożytnej UJK pełnił dr Tadeusz Siuta, a p.o. kierownika Katedry Historii Starożytnej UJK pełnił prof. Kazimierz Majewski
Życie prywatne Jego żoną była Nadzieja z domu Nawrocka.
Ordery i odznaczenia
Krzyż Komandorski z Gwiazdą Orderu Odrodzenia Polski - 19 marca 1936 roku za wybitne zasługi dla państwa