17 sierpnia 2018 Bento został mianowany menedżerem Korei Południowej z kontraktem obejmującym mistrzostwa świata w 2022 r. Podczas Pucharu Azji AFC 2019 w Zjednoczonych Emiratach Arabskich jego drużyna została wyeliminowana w ćwierćfinale 1:0 z Katarem. Na mistrzostwach świata zakwalifikował się do 1/8 finału gdzie przegrał 4:1 z Brazylią. Wkrótce potem opuścił stanowisko, stwierdzając, że chce zrobić sobie przerwę.
W 2023 był jednym z kandydatów do objęcia stanowiska selekcjonera reprezentacji Polski.
9 lipca 2023 Bento zastąpił Rodolfo Arruabarrenę na czele drużyny narodowej Zjednoczonych Emiratów Arabskich. W swoim debiucie, 12 września 2023, wygrał 4:1 w towarzyskim meczu z Kostaryką w Zagrzebiu. Bento i jego sztab zostali zwolnieni przez związek piłkarski Zjednoczonych Emiratów Arabskich 26 marca 2025, pomimo wyjazdowego zwycięstwa 1:2 z Koreą Północną w eliminacjach do Mistrzostw Świata 2026.
Trofea Jako piłkarz mistrzostwo Portugalii – Sporting CP 2001-2002– Superpuchar Portugalii – Sporting CP: 2000.