Kwiaty Zebrane w szarozielone koszyczki, przy czym kwiatostany męskie są drobne, kuliste i skupione na szczytach pędów. Kwiatostany żeńskie wyrastają na krótkich szypułkach skupione po kilka lub są siedzące w górnej części pędu. Ich okrywa jest wąsko jajowata, o długości zwykle do 1,5 cm, miękko owłosiona i pokryta zagiętymi na szczycie cierniami. Ciernie te są krótsze od połowy średnicy okrywy. Na szczycie okrywy znajdują się dwa krótkie dzioby zakończone ostrym kończykiem różnie ułożone względem siebie (prosto wzniesione, rozchylone lub zagięte ku sobie). Wewnątrz okrywy rozwijają się dwa kwiaty pozbawione korony. Gatunek podobny Rzepień włoski Xanthium orientale różni się żółtą barwą koszyczków z kwiatami żeńskimi, na których ciernie są podobne lub dłuższe od połowy grubości okrywy. Okrywy koszyczków u tego gatunku osiągają ponad 1,5 cm długości, włoski je okrywające są sztywne, a wieńczące je dzioby są zwykle łukowato zagięte;