W 2016 został zatrzymany przez funkcjonariuszy Centralnego Biura Antykorupcyjnego, a następnie prokurator Prokuratury Krajowej przedstawił mu zarzuty wręczenia łapówki osobie pełniącej funkcję publiczną. Włodzimierz Skalik nie przyznał się do popełnienia zarzucanego mu czynu. Śledztwo w tej sprawie zostało ostatecznie umorzone w 2021 z uwagi na brak danych dostatecznie uzasadniających podejrzenie popełnienia przestępstwa.
Działalność polityczna W 1989 jako kandydat Aeroklubu PRL bez powodzenia ubiegał się o mandat posła, przegrywając m.in. z kandydatem KO „Solidarność” Jarosławem Kapsą.. W wyborach samorządowych w 1998 bezskutecznie ubiegał się o mandat radnego Częstochowy z listy Częstochowskiego Forum Samorządowego. W 2006 uzyskał mandat radnego Sejmiku Województwa Śląskiego z listy Prawa i Sprawiedliwości. W 2007 przeszedł do Prawicy Rzeczypospolitej, został jej pełnomocnikiem na okręg częstochowski. Bez powodzenia ubiegał się o mandat poselski w przedterminowych wyborach parlamentarnych z listy Ligi Polskich Rodzin. W styczniu 2008 po zmianie koalicji w sejmiku został członkiem klubu radnych Przymierze Regionalne, który potem się rozpadł. Włodzimierz Skalik nie ubiegał się w 2010 o reelekcję. W 2013 został właścicielem spółki z o.o. Premium-Media.pl z siedzibą w Częstochowie.