Kierując się od wschodu w kierunku zachodnim, występują kolejno: kanał Kii, pomiędzy Honsiu i Sikoku; zatoka Ōsaka; cieśnina Akashi, pomiędzy wyspą Awaji i miastem Kobe, łączy zatokę Ōsaka z Harima-nada; Harima-nada, pomiędzy wyspami Awaji i Shōdo; cieśnina Bisan, przewężenie morza pomiędzy prefekturami Okayama i Kagawa; Bingo-nada, pomiędzy wyspami Kasaoka i Geiyo; Hiuchi-nada, pomiędzy półwyspami Shōnai i Takanawa; Aki-nada, pomiędzy wyspami Geiyo i Bōyo; zatoka Hiroshima; Iyo-nada, na południe od Aki-nada pomiędzy wyspą Yashiro a półwyspem Kunisaki; Suō-nada, na północ aż do cieśniny Kammon; Hibiki-nada, na północ od cieśniny Kammon, pomiędzy zachodnim brzegiem Honsiu i Genkai-nada; kanał Bungo, pomiędzy Iyo-nada i Hyūga-nada (otwarty Pacyfik).
Klimat Południe Japonii znajduje się pod wpływem ciepłego prądu Kuro Siwo, zapewniającego ciepłe lata i łagodne zimy. Obszary wokół Morza Wewnętrznego, ze względu na relatywną izolację od oceanu, charakteryzują się gorętszymi latami, niż obszary na wybrzeżu pacyficznym (Osaka w sierpniu należy do najcieplejszych miast w Japonii). Opady są nieco mniejsze, ze względu na osłonięcie przez góry od monsunu;