Upamiętnienie Ks. Ferdynanda Machaya uczczono w Krakowie przez nazwanie jego imieniem ulicyPołożenie ulicy Księdza Ferdynanda Machaya na planie Krakowa wikimapia.org.Położenie ulicy Księdza Ferdynanda Machaya na planie Krakowa openstreetmap.org. w Bronowicach Małych. Jego imię (w formie ulica Księdza Ferdynanda Machaja) nosi główna droga przez osiedle Machajowa w JabłoncePołożenie ulicy Księdza Ferdynanda Machaja na planie Jabłonki openstreetmap.org..
4 maja 1989 roku – w setną rocznicę urodzin – w Kościele Mariackim w Krakowie została odsłonięta i poświęcona przez ks. biskupa Jana Szkodonia tablica upamiętniająca ks. Machaya. Ufundował ją pochodzący z Orawy ks. Władysław PilarczykAnd: Tablica ku czci ks. infułata dra Ferdynanda Machaya, w: „Wierchy” R. 57 (1988–1991), s. 237..
Jego imię nosi Towarzystwo Przyjaciół Orawy wpisane do Rejestru Stowarzyszeń 27 maja 2002 r..
Wdzięczni swojemu proboszczowi parafianie Zwierzyńca ufundowali tablicę, którą wmurowano w wewnętrzną stronę muru okalającego kościół Najświętszego Salwatora. Odsłonięcia tablicy dokonano 16 października 2004 roku.
Od 2 czerwca 2006 roku jest patronem szkoły w Jabłonce.
28 listopada 2011 roku przed budynkiem szkoły nastąpiło odsłonięcie jego pomnika.