Po powrocie do ojczyzny w 1827 ożenił się z Julie Krummacher (ur. 25 października 1804 w Duisburg, zm. 22 maja 1909 w Dessau), córką krajowego superintendenta księstwa Anhalt-Bernburg Friedricha Adolfa Krummachera. Z tego małżeństwa pochodziło sześcioro dzieci: Bertha (ur. 14 kwietnia 1828), Anna (ur. 7 lutego 1831), Gerhard (ur. 27 maja 1833), Adolph (ur. 9 maja 1835), Benno (ur. 18 kwietnia 1837) i Elisabeth (ur. 22 września 1839). Jego wnuk (syn Bennona) podpułkownik Wilhelm von Kügelgen był w latach 1919-1925 osobistym sekretarzem i adiutantem Paula von Hindenburga. thumb|Ludwig Richter, portret pędzla Wilhelma von Kügelgena W 1833 r. Wilhelm von Kügelgen został malarzem nadwornym w letniej rezydencji książąt Anhalt-Bernburg w Ballenstedt. W 1853 r. został opiekunem chorego umysłowo Aleksandra Karola von Anhalt-Bernburga, ostatniego księcia Anhalt-Bernburga. Wydane pośmiertnie w 1870 r. wspomnienia Jugenderinnerungen eines alten Mannes stały się ulubioną lekturą niemieckiego mieszczaństwa i do 1922 r. miały 230 wydań.
Dom malarza w Ballenstedt, przy Kügelgenstraße 35a, istnieje do dziś.
Od 1993 "Kunstkreis Sachsen-Anhalt" przyznaje artystom stypendium im. Wilhelma von Kügelgena.
Nazwiskiem malarza została nazwana planetoida (11313) Kügelgen.