A tak pisał o pracy ks. Czaplińskiego w Bogatem Bolesław Prus w Kartkach z podróży (1877): „Najtroskliwszym jednak i najhojniejszym opiekunem kościoła był miejscowy proboszcz, kanonik Czapliński, który w ciągu trzydziestoletnich rządów w Bogatem taką sobie jako odnowiciel sławę zjednał, że go aż do silnie zaniedbanej przasnyskiej fary przeniesiono.”
W 1877 został proboszczem i dziekanem w Przasnyszu. Wkrótce po objęciu nowej parafii, z wielką energią przystąpił do restauracji zabytkowego kościoła farnego. Prace remontowe kontynuowano jeszcze w 1890.
Ks. Czapliński był człowiekiem niezwykle muzykalnym. Zorganizował w parafii znakomity chór, sam grał na kilku instrumentach, komponował. Interesował się również historią Przasnysza. W archiwum klasztoru bernardynów odnalazł starą kronikę zakonną i upowszechnił zawartą w niej legendę o powstaniu miasta. Napisał dwie krótkie monografie Przasnysza (w Obrazie statystycznym powiatu przasnyskiego A. N. Leontiewa z 1889 oraz Kronice Rodzinnej z 1902). Był również autorem pracy O czci Najświętszej Marii Panny w parafii przasnyskiej (1904).