W 1991 roku pod auspicjami ONZ Front Polisario i Maroko ogłosiły zawieszenie broni. Zgodnie z porozumieniem o zawieszeniu broni z 1991 roku w Saharze Zachodniej ma się odbyć referendum niepodległościowe. Mimo trwających przygotowań wciąż jednak nie wyznaczono jego dokładnej daty. Sahara Zachodnia podzielona jest murem granicznym na dwie części: zachodnią – kontrolowaną przez Maroko oraz wschodnią (około 1/3 terytorium) – pozostającą w rękach Frontu Polisario, na której obszarze funkcjonuje Saharyjska Arabska Republika Demokratyczna. Obecnie kontrolowany przez Front rząd Sahary Zachodniej znajduje się na uchodźstwie w mieście Tinduf w sąsiedniej Algierii.
W 2016 roku zmarł długoletni przywódca organizacji Muhammad Abd al-Aziz.
Doktryna ideologiczna Ugrupowanie od chwili założenia miało charakter lewicowy, świecki i nacjonalistyczny. Do przełomu lat 80. i 90. lewicowość Frontu przybierała skrajny (lecz nie marksistowski) charakter. Z czasem Front odrzucił postulaty budowy społeczeństwa bezklasowego i zaakceptował wolny rynekAnouar Boukhars, Jacques Roussellier Perspectives on Western Sahara: Myths, Nationalisms, and Geopolitics s. 79.. Wraz z ideologiczną odwilżą pod koniec lat 80.