Dla swojego pierwotnego zespołu rozegrał 123 mecze i strzelił 13 bramek.
Latem 2006 roku Gabilondo przeszedł do wielkiego rywala Sociedadu, Athletic Bilbao. W drużynie prowadzonej wówczas przez Felixa Sarriugarte swój pierwszy mecz zaliczył 27 sierpnia, a w derbach Kraju Basków z poprzednim klubem Igora padł remis 1:1. W całym sezonie wystąpił 33 razy i zdobył 4 gole przyczyniając się do utrzymania Athletic w La Liga.
Sezon Klub Kraj Rozgrywki Mecze Bramki 1997/98 Real Sociedad B
Tercera División 20 2 1998/99 Real Sociedad B
Tercera División 38 4 1999/00 Real Sociedad B
Tercera División 44 5 2000/01 Real Sociedad
Primera División 12 2 2001/02 Real Sociedad
Primera División 15 3 2002/03 Real Sociedad
Primera División 23 1 2003/04 Real Sociedad
Primera División 32 5 2004/05 Real Sociedad
Primera División 25 1 2005/06 Real Sociedad
Primera División 16 1 2006/07 Athletic Bilbao
Primera División 33 3 2007/08 Athletic Bilbao
Primera División
Łącznie w Primera División