Obecnie w Novae działają trzy ekspedycje polskie oraz dwie bułgarskie. Ekspedycja Ośrodka Badań nad Antykiem Europy Południowo-Wschodnie UW – pod kierunkiem Piotra Dyczka – bada obszar leżący wzdłuż via principalis, po wschodniej stronie principia – tzw. odcinek XII, ekipa poznańska – pod kierunkiem Eleny Kleniny – obszar po zachodniej stronie principia „arsenał”, ekipa Wydziału Archeologii – pod kierunkiem Agnieszki Tomas – obszar na południe od principia, ekspedycja bułgarska pod kierunkiem Evgenii Genčevej obszar leżący przy zachodniej bramie Novae – porta principalis sinistra i odcinek via principalis, oraz druga ekipa bułgarska pod kierunkiem Pavliny Baičevej Vladkovj obszar tzw. villa extra muros.
Poszczególne obszary wykopaliskowe, czyli odcinki oznaczono liczbami rzymskimi. Odcinek I – bułgarski, obejmował część fortyfikacji wschodnich, II – polski, część murów zachodnich, III – polski –narożnik północni-zachodni twierdzy, IV – polski, obszar leżący u zbiegi via praetoria i via sagularis, V – polski, bramę zachodnią porta principalis sinistra, VI – polski, fragment północnego muru obronnego, VII i VIII – bułgarski, odpowiednio południowo-zachodni narożnik murów obronnych oraz południowy ciąg muru obronnego wraz z bramą porta decumana, VIII a – bułgarski, tzw.