W czasie II wojny światowej osada ucierpiała. Przy obecnej ul. Ofiar Stutthofu w czasie II wojny światowej istniał obóz pracy przy fabryce benzyny syntetycznej w Policach będący podobozem KL Stutthof (niem. Außenlager Pölitz bei Stettin). Przy ulicy Ofiar Stutthofu znajdują się dwa pomniki.
Zostało zajęte w kwietniu 1945 przez wojska radzieckie (2 Front Białoruski – 2 Armia Uderzeniowa) a zostało oddane pod administrację polską we wrześniu 1946 po likwidacji tzw. Enklawy Polickiej. Nazwę Mścięcino wprowadzono urzędowo w 1946 roku, zmieniając poprzednią niemiecką MessenthinRozporządzenie Ministrów: Administracji Publicznej i Ziem Odzyskanych z dnia 12 listopada 1946 r. o przywróceniu i ustaleniu urzędowych nazw miejscowości (, s. 5). Wcześniej przez pierwsze powojenne miesiące w użyciu były nieoficjalne tymczasowe nazwy Mieżęcin i Mierzencin.
Po 1945 Mścięcino nadal należało do Szczecina, a w 1954 roku północna i wschodnia część została przyłączona do Polic. Południową część znajdującą się do końca 2007 roku w Szczecinie – fragment Parku Leśnego Mścięcino, zabudowania przy ul. Ofiar Stutthofu włączono z początkiem roku 2008 w granice gminy PoliceRozporządzenie Rady Ministrów z dnia 24 lipca 2007 r. ().