System ten ma pewne podobieństwa do przyjętych w Oksfordzie i Cambridge, jednak koledże University of Toronto nie mają aż takiego zakresu autonomii i dla większości studentów pełnią wyłącznie funkcje administracyjne, co najwyżej oferując kursy w kilku wyspecjalizowanych dziedzinach lub kursy pierwszego roku.
Równolegle z tym różnorodnym zbiorem koledżów uniwersytet dysponuje również standardowymi, ogólnouczelnianymi fakultetami. Jest również skonfederowany z dużą liczbą odrębnych instytutów i bibliotek.
thumb|Graduate House – akademik dla studentów po licencjacie
Pełna lista koledży i wydziałów Skonfederowane uniwersytety (założony w 1851, skonfederowany od 1904) (założony w 1852, współpracujący z Uniwersytetem w Toronto od 1881, pełna federacja od 1910) (założony w 1836, skonfederowany od 1892)
Koledże (założony w 1853) (założony w 1962) (założony w 1964) (założony w 1974)
Fakultety
Instytuty
School of Graduate Studies
Koledże i fakultety tworzące Toronto School of Theology thumb|Knox College (United Church of Canada) (Low Anglican) (Jesuit) Knox College () (Basilian) Trinity College Faculty of Divinity (High Anglican)
Inne jednostki uniwersytetu
Pontifical Institute of Medieval Studies
Osoby związane z uniwersytetem
Kampus uniwersytecki thumb|Hart House