W lipcu 2008 za milion euro został sprzedany do holenderskiego FC Groningen. Zadebiutował tam 29 sierpnia 2008 w wygranym 4-0 pojedynku z Vitesse Arnhem. Mimo tego, iż Granqvist występował na pozycji obrońcy, imponował zaskakującą skutecznością strzelecką, umiejętnością, której nie objawiał we wcześniejszych etapach kariery. O ile w sezonie 2008/09 miał ich na koncie 4, a 2009/10 – 6, o tyle w sezonie 2010/11 zdobył 11 goli w lidze. Był wówczas drugim najbardziej skutecznym graczem drużyny, ustępując jedynie napastnikowi Timowi Matavžowi.
Następnym klubem w jego karierze została Genoa CFC. Spędził w niej dwa lata, w Serie A rozegrał 63 spotkania i zdobył zaledwie (w porównaniu z osiągnięciami z Groningen) 2 gole. Od sezonu 2013/14 jest natomiast graczem zespołu z rosyjskiej Priemjer-Ligi, FK Krasnodar.
28 stycznia 2018 roku Andreas Granqvist ogłosił, że powróci do Helsingborgs IF (w 2018 r. klub występował w Superettan, 2. lidze szwedzkiej) po Mistrzostwach Świata w Rosji. Decyzję taką podjął dla swojej żony i ich nowego dziecka. W lipcu 2018 r. dołączył do klubu i podpisał 3,5-letni kontrakt. Pod koniec 2018 r.