Wysunięto niedawno przypuszczenie, że mógł być przodkiem rzędu krokodyli.
Klasyfikacja Pozycja filogenetyczna Proterosuchus w Crocopoda:
Proterosuchus był wczesnym przedstawicielem kladu Archosauriformes, który zawiera również krokodyle, pterozaury i dinozaury, w tym ptaki. Jest to rodzaj z rodziny Proterosuchidae, która obejmowała również Archosaurus. Proterosuchidae jest, zgodnie z definicją, najbardziej podstawowy kladem z archozaurów, jako Archosauriformes definiuje się go na podstawie pozycji filogenetycznej. Zgodnie z przedkladystyczną taksonomią, Proterosuchus był klasyfikowany w rzędzie Thecodontia i podrzędzie Proterosuchia. Oba taksony są obecnie rozpoznawane jako grupy parafiletyczne bazalnych archozaurów.
Gatunki Uznane gatunki Proterosuchus zawiera obecnie trzy ważne gatunki, wszystko z dolnego triasu z obszaru dzisiejszej Południowej Afryki.
Proterosuchus fergusi został nazwany w 1903 roku przez Roberta Brooma na podstawie okazu z Tarkastad podarowanego przez Johna Fergusa, od którego nazwiska gatunek został nazwany. Jest znany z kilku okazów, a gatunki Chasmatosaurus vanhoepeni i Elaphrosuchus rubidgei są jego młodszymi synonimami. Holotyp jest słabo zachowany i nieokreślony.