1 czerwca 1943 podczas likwidacji getta, ocalał z masakry, gdyż wydostał się spod ciał rozstrzelanych i uciekł na Węgry do Budapesztu, gdzie w dzielnicy ukrywał się dzięki pomocy komendanta żandarmerii o nazwisku Endre Laszlo. Do Krakowa wrócił w 1945. W latach 1954–1974 pracował jako profesor w ASP. Brał udział w organizowaniu tzw. Drugiej Grupy Krakowskiej i był jej wieloletnim prezesem.
Uprawiał malarstwo sztalugowe, grafikę, monotypię i serigrafię. Jego prace wystawiane były m.in. w Nowym Jorku, Moskwie, Wenecji, Kopenhadze, Londynie, Pradze i Tokio. Wiele muzeów polskich i zagranicznych posiada w swoich zbiorach jego dzieła.
Mieszkał przy ulicy Jadwigi z Łobzowa. Pochowany w alei zasłużonych cmentarza Rakowickiego w Krakowie (kwatera LXIX pas C-1-5).
Ordery i odznaczenia Order Sztandaru Pracy I klasy (1979) Order Sztandaru Pracy II klasy (1964) Krzyż Kawalerski Orderu Odrodzenia Polski
mały|Grób Jonasza Sterna na cmentarzu Rakowickim w Krakowie
Nagrody Nagroda Miasta Krakowa (1961) Nagroda Ministra Kultury i Sztuki I stopnia (1969) Nagroda im. Cypriana Kamila Norwida (1979) Nagroda „Trybuny Ludu” (1984)