Autobus ten został wprowadzony do produkcji w 2001 roku. W początkowym okresie dopuszczano również możliwość zamówienia tego pojazdu z silnikiem MAN D0826LUH12 (oznaczenie M101M), jednak wersja z tym silnikiem nie doczekała się zamówień i nie wyprodukowano nawet jednego egzemplarza.
W 2003 roku pojawiły się pierwsze zmiany. Pojazd zaczęto wyposażać w silnik Iveco F4AE0682C o mocy maksymalnej 176 kW (239 KM) spełniający normę Euro-3.
W 2004 roku do oferty dołączył również model z dodatkowymi trzecimi drzwiami na tylnym zwisie (układ drzwi: 1-2-1) oraz z manualną 6-biegową skrzynią typu ZF 6S-700BO.
W październiku 2006 roku w związku z wejściem w życie normy Euro-4 po raz kolejny zmieniono jednostkę napędową. Nowym silnikiem jest niezwykle mocny jak na tę klasę autobusów motor Iveco F4AE3682E o mocy maksymalnej 194 kW (264 KM).
W roku 2007, Jelcz M101 otrzymał wzorem Jelcza Mastero, wyrównaną linię okien.
W październiku 2008 roku ze względu na brak możliwości kontynuowania produkcji autobusów przez ZS Jelcz, zakończono produkcję tego modelu.