W jedenastym sezonie Derek zostaje zatrudniony przez rząd przy prestiżowym projekcie neurochirurgicznym i przeprowadza się do Waszyngtonu. Meredith źle znosi rozłąkę z mężem, zamieszkuje z nią siostra Dereka – Amelia Shepherd, która zostaje nowym szefem neurochirurgii w Grey Sloan Memorial (na miejsce Dereka). W pewnym momencie Derek zaczyna tęsknić za domem i rodziną i postanawia zrezygnować z projektu i wrócić do Seattle. Kiedy jest już w drodze do domu, na skutek tragicznego wypadku samochodowego trafia do szpitala, w którym przez błąd lekarzy wchodzi w śmierć mózgową. Meredith musi zdecydować o odłączeniu go od aparatury. Derek umiera. Po pogrzebie Meredith wyjeżdża z dziećmi i znika z Seattle na prawie rok. Nikt nie wie co się z nią dzieje i gdzie jest, nie odbiera telefonów od przyjaciół. W końcu Alex Karev otrzymuje telefon i przywozi do domu Meredith, Zolę, małego Baileya i – jak się okazuje – malutką córkę Meredith i Dereka – Ellis. Meredith nie potrafi się odnaleźć w domu na wzgórzu, w którym wszystko przypomina jej męża, dlatego Alex postanawia odsprzedać jej dom jej matki.