W finale siódmego sezonu Alex mówi Huntowi, że Meredith namieszała w badaniach. Grey zostaje zawieszona, a jej związek z Derekiem legł w gruzach. Ostatecznie winę lekarki bierze na siebie dr Webber, który wiedział, że kobieta chciała jedynie pomóc jego żonie, a nie zaszkodzić badaniom.
Wkrótce potem pracownica socjalna przyznaje Meredith opiekę nad Zolą. Meredith, aby ratować swój związek z Derekiem, postanawia nie mieszać życia zawodowego z życiem prywatnym. Ma duży dylemat z powodu wyboru specjalizacji. W finale ósmego sezonu bierze udział w katastrofie lotniczej, w wyniku której ginie jej siostra Lexie oraz Mark Sloan
W sezonie dziewiątym Meredith cierpi po stracie przyrodniej siostry. Dużym powodem do zmartwienia jest też nie w pełni sprawna ręka Dereka, przez którą chirurg nie może operować. Dzięki jej determinacji Derek zgadza się poddać kolejnej operacji. Okazuje się też, że Meredith – mimo poważnych problemów z zajściem w ciążę – spodziewa się dziecka. Bardzo boi się, że może znowu poronić, dlatego o swym błogosławionym stanie nie mówi nikomu poza Derekiem, a potem także jednej z jego sióstr (tylko dlatego, że była ona dawcą nerwu dla Dereka). Z powodu katastrofy samolotu wraz z innymi poszkodowanymi otrzymuje spore odszkodowanie, które, jak się okazuje, musi wypłacić szpital, co doprowadza do jego bankructwa.