Obecne linie MKS Sanok obecnie obsługuje 16 regularnych linii autobusowych. 1 września 2012 roku wszedł w życie nowy rozkład jazdy, ze zmienioną siatką połączeń. Zmiany były spowodowane przede wszystkim zmniejszającą się liczbą pasażerów korzystających z komunikacji miejskiej, a także jej wysokimi kosztami utrzymania, które w ostatnich latach bardzo wzrosły. W 2011 roku straty poniesione przez komunikację miejską wyniosły 1,5 mln zł. Straty są pokrywane z kasy miejskiej. Do tej pory linie komunikacyjne w szczycie obsługiwało 20 autobusów, po reorganizacji jest ich 15. Liczbę linii z 18 zmniejszono do 10. Wprowadzono także bilet 30-minutowy. Mimo zmniejszenia linii autobusowych i liczby kursów, dostępność komunikacyjna pozostała na niezmienionym poziomie. We wrześniu 2019 roku wprowadzono pierwsze od dłuższego czasu znaczące zmiany w kursowaniu autobusów MKS. Powstały nowe linie 3A, 4A oraz 50A. Uruchomiono również nowy przystanek na nowo wybudowanym Dworcu Autobusowym. 1 września 2020 roku została uruchomiona linia 18 na trasie Sanok – Bukowsko – Wola Piotrowa łącząca gminę miasta Sanoka z gminą Bukowsko. 17 maja 2021 roku uruchomiona została linia 19 łącząca gminę miasta Sanoka, gminę Bukowsko oraz gminę Zarszyn.