Martin Jakubko (ur. 26 lutego 1980 w Chminianskiej Novej Vsi) – piłkarz słowacki grający na pozycji napastnika.
Kariera klubowa Jakubko piłkarską karierę rozpoczął w klubie Tatran Preszów. W sezonie 1999/2000 zadebiutował w pierwszej lidze słowackiej, ale debiut był zarazem jego jedynym meczem w lidze. Przez kolejne dwa lata także miał problemy z wywalczeniem miejsca w wyjściowej jedenastce Tatrana i w tym okresie nie strzelił żadnego gola. W 2002 roku Tatran spadł do drugiej ligi, a w niej Jakubko uzyskał formę i w półtora roku strzelił 21 goli. W zimie 2004 przeszedł do pierwszoligowej Dukli Bańska Bystrzyca i do końca sezonu zdobył 10 bramek, a jego nowy klub został wicemistrzem kraju ulegając MŠK Žilina tylko na skutek gorszego bilansu meczów bezpośrednich. W sezonie 2004/2005 wystąpił w Pucharze UEFA, a w lidze strzelił 14 bramek będąc najlepszym strzelcem zespołu, który zakończył rozgrywki ligowe na 3. pozycji. Dukla zdobyła też Puchar Słowacji.