Dnia 1 kwietnia 1920 roku dyrektorem polskim mianowano przybyłego z Krakowa Zygmunta Palisza. Centralne władze oświatowe zgodziły się na przekształcenie 1 stycznia 1922 roku dotychczasowego progimnazjum w pełną 8-letnią szkołę średnią – Gimnazjum Państwowe w Kościerzynie. W dniu 1 września 1935 roku przeniesiono szkołę do gmachu zlikwidowanego Seminarium Nauczycielskiego (obecnie mieści się tam Powiatowy Zespół Szkół nr 2). W szkole aktywne były: ZHP (od 1921 r.), Towarzystwo Filomatów im. Adama Mickiewicza (od 1922 r.), Sodalicja Mariańska (od 1924 r.), Kółko Krajoznawcze (od 1929 r.)
W myśl ustawy o szkolnictwie w 1932 roku gimnazjum 8-letnie zostało przekształcone w 1933 roku w 4-letnie Państwowe Gimnazjum Męskie typu klasycznego, a od 1937 r. uczniowie po zdaniu małej matury mogli kontynuować naukę w liceum ogólnokształcącym o profilu humanistycznym. W 1934 roku patronem szkoły został Józef Wybicki. W roku szkolnym 1924/1925 uczyło się 158 uczniów, w roku szkolnym 1931/1932 – 210 uczniów.
Czas II wojny światowej był okresem tragicznych spustoszeń zarówno wśród nauczycieli, jak i wśród uczniów.