Miejsce Drużyna Mecze Punkty Zwyc. Rem. Por. Bramki 1 472112-1 2 462028-3 3 441122-8
Grupa 12
Miejsce Drużyna Mecze Punkty Zwyc. Rem. Por. Bramki 1 61550113-2 2 61240214-5 3 6930314-6 4 600062-30
Runda trzecia 20 drużyn zostało podzielonych na 5 grup po 4 drużyny w każdej. Zwycięzcy grup awansowali do finałów Mistrzostw Świata, natomiast do Pucharu Narodów Afryki awansowali, oprócz zwycięzców grup, dodatkowo drużyny z 2. i 3. miejsc. Jeśli RPA awansuje do tej rundy, wszystkie punkty zdobyte przez tę reprezentację będą liczone jako eliminacje Pucharu Narodów Afryki, nie jako eliminacje Mistrzostw Świata. Jeśli Angola awansuje do tej rundy, wszystkie pozostałe drużyny w grupie, do której została rozlosowana, automatycznie awansują do Pucharu Narodów Afryki.
Drużyny Rozstawienie z rankingu FIFA z października 2008
Mecze Grupa A
Miejsce Drużyna Mecze Punkty Zwyc. Rem. Por. Bramki 1 (PA) 6134119-2 2 (PA) 693039-7 3 (PA) 682223-7 4 630333-8 Legenda: PA - zespoły zakwalifikowane do Pucharu Narodów Afryki 2010
Grupa B
Miejsce Drużyna Mecze Punkty Zwyc. Rem. Por. Bramki 1 (PA) 6123309-4 2 (PA) 6112317-4 3 (PA) 672133-5 4 631055-11 Legenda: PA - zespoły zakwalifikowane do Pucharu Narodów Afryki 2010
Grupa C