Na stanowisko głównego trenera przyjęto Johna Thompsona III.
College Już na pierwszym roku jako freshmen w zespole Georgetown Hoyas, zdobył nagrodę dla najlepszego pierwszoroczniaka konferencji Big East Conference w 2005 (Big East Rookie of The Year) wraz z Rudy Gayem z Connecticut Huskies.
Rok później Green wraz z kolegą z zespołu Royem Hibbertem został wybrany do drugiego najlepszego zespołu konferencji Big East (All-Big East Second Team of the Year).
Jako junior na Uniwersytecie Georgetown poprowadził swój zespół do Final Four NCAA po raz pierwszy od 1985. W półfinale przeciwko drużynie Notre Dame Fighting Irish rzucił 30 punktów, zaś w finale 21 przeciwko Pittsburgh Panthers. Green poprowadził swój zespół do pierwszego tytułu Big East od roku 1989. Po tych wydarzeniach Green został wybrany do All-Big East First Team oraz został okrzyknięty najbardziej wybitnym zawodnikiem (Most Outstanding Player) turnieju Big East.
Zapisał się w historii swojej szkoły jako 17 na liście strzelców, 16 na liście najlepiej zbierających i 12 asystujących. Jeff był kapitanem zespołu Uniwersytetu Georgetown, który był prowadzony przez trenera Johna Thompsona III.