Od utworzenia sekcji do wybuchu II wojny światowej, kierownictwo sekcji sprawowali kolejno: A.Krakowski, H.Czerniak, F.Krajnik i W.Michalak.
W 1945 roku reaktywował swoją działalność Okręgowy Związek Piłki Nożnej, ujmując w ramy organizacyjne rozgrywki piłkarskie. Drużyna GKSu również zgłoszona została do rozgrywek eliminacyjnych i została zakwalifikowana do klasy B. W sezonie 1945/1946 zespół w tych rozgrywkach, a także w meczach towarzyskich rozegrał 39 spotkań, z których wygrał 22. W 1957 roku w wyniku reorganizacji rozgrywek seniorzy zaliczeni zostali do nowo utworzonej ligi wojewódzkiej. W tym samym roku juniorzy z powodzeniem występowali w lidze międzywojewódzkiej. Zdobyli też Puchar Gazety Pomorskiej. W 1961 roku juniorzy wywalczyli upragniony awans do ligi międzywojewódzkiej. W sezonie 1963/64 juniorzy zdobyli tytuł mistrza okręgu i reprezentowali okręg w zmaganiach o mistrzostwo Polski. W sezonie 1964/65 juniorzy grając w nowym składzie zajęli drugie miejsce w lidze okręgowej. W 1966 roku najmłodsi piłkarze osiągnęli sukces w postaci zdobycia tytułu Mistrza Okręgu. W latach siedemdziesiątych i osiemdziesiątych drużyny Olimpii nie uzyskały liczących się wyników, uczestnicząc w rozgrywkach na szczeblu okręgu w poszczególnych kategoriach wiekowych.