Chorobotwórczość U człowieka kryptosporydioza, która objawia się: nudnościami, wymiotami, biegunką, a niekiedy również dusznościami, kaszlem oraz gorączką. Zakażenie następuje po spożyciu oocyst, których dawka infekcyjna dla zdrowego człowieka wynosi około 30. U osób ze zmniejszoną odpornością do zainfekowania niekiedy wystarczy tylko jedna cysta, zaś przebieg choroby jest znacznie cięższy (niekiedy nawet śmiertelny). Poza układem pokarmowym, znane są również przypadki zakażeń C. parvum układu oddechowego u dzieci. Jak dotąd nie został jednak poznany jego sposób rozmnażania się w tym układzie.
U zwierząt (poza człowiekiem) zakażenie zwykle przebiega bezobjawowo, jedynie u młodych osobników mogą występować objawy ze strony układu pokarmowego.
Cykl życiowy thumb|Cykl życiowy Cryptosporidium spp. Oocysty zawierające sporozoity dostają się do organizmu wraz z pokarmem, wodą lub unoszącym się w powietrzu kurzem. W jelicie cienkim sporozoity uwalniają się z oocyst i przylegają do enterocytów, przez które niemal od razu zostają otoczone, tworząc wakuolę pasożytniczą (ang. ). Sporozoit przekształca się w trofozoit. Po 1–8 dniach zachodzi schizogonia, w wyniku której powstaje 8 merozoitów. Te, po uwolnieniu, zakażają następne enterocyty.