Pierwszy sezon zakończony został na siódmej lokacie, natomiast następny rok był lepszy – drużyna z Myszkowa zakończyła zmagania na czwartym miejscu.
Po zakończeniu sezonu 1994/95, na walnym zebraniu klubu 30 czerwca 1995 roku, podjęto uchwałę o zmianie nazwy poprzez dodanie członu "KRISBUT", przez co pełna nazwa zespołu brzmiała KS Krisbut/Papiernik Myszków.
Rok jubileuszowy i dwukrotna fuzja Jubileuszowy rok 1997 był czasem ogromnej sportowej szansy. Po rundzie jesiennej klub z Myszkowa plasował się na czwartym miejscu i tylko 3 punkty dzieliły go od I ligi, jednak drużynie nie udało się awansować do najwyższej ligi.
Rok 1998, po fuzji z Zielonymi Żarki, powstał (M-ŻKS) Myszkowsko-Żarecki Klub Sportowy.
Rok 1999, po fuzji z Wartą Myszków, powstał KS Myszków.
Kryzys MKS-u Następne lata to kryzys myszkowskiej piłki. W sezonie 2001/2002 nastąpił spadek do III ligi. Przed rozpoczęciem rundy wiosennej KS Myszków zmienił nazwę na Miejski KS Myszków. W sezonie 2002/2003 klub zaliczył drugi z rzędu spadek, tym razem do IV ligi, w której występował do sezonu 2009/2010, w którym to zespołowi udało się awansować do III ligi.