Rodzice Prince’a rozwiedli się w 1968, a jego matka jeszcze w tym samym roku wyszła za Haywarda Bakera – Prince wówczas przyjął nazwisko ojczyma. Napięte relacje z Bakerem doprowadziły do przeprowadzki wówczas 12-letniego Prince’a do ojca. Nastolatek później pomieszkiwał u swojej ciotki, Olivii Nelson, a następnie wprowadził się do szkolnego przyjaciela, Andrégo Andersona.
We wczesnym dzieciństwie miewał ataki epilepsji. Miał zdiagnozowaną niestabilność psychiczną i rozdwojenie jaźni. Uczęszczał do Kościoła Adwentystów Dnia Siódmego. Uczył się w gimnazjum Bryanta i liceum Centrum High. W tym okresie był prześladowany przez rówieśników ze względu na swoją nieśmiałość, charakterystyczny sposób ubierania się i oryginalne imię. Doświadczył też rasizmu, któremu przeciwstawiał się w dorosłym życiu.
Kariera Początki Zafascynowany jednym z koncertów ojca, na który wybrał się z matką, gdy miał sześć lat, postanowił związać życie z muzyką.. Kiedy miał siedem lat, skomponował swój pierwszy utwór – „Funkmachine”. Samodzielnie opanował grę na fortepianie, gitarze i perkusji.