Międzynarodowe Puchar Mistrzów CONCACAF zwycięstwo (2): 1986, 2004 drugie miejsce (3): 1971, 1992, 1999 Copa Interclubes UNCAF zwycięstwo (3): 1996, 2002, 2005 drugie miejsce (2): 1999, 2000 Liga CONCACAF zwycięstwo (1): 2020 drugie miejsce (1): 2022 Puchar Ameryki Centralnej CONCACAF zwycięstwo (3): 2023, 2024, 2025 drugie miejsce (0): – Copa Interamericana zwycięstwo (0): – drugie miejsce (1): 1987
Historia Alajuelense założony został 18 czerwca 1919 roku przez grupę przyjaciół będących członkami drużyny o nazwie El Once de Abril (co znaczy 11 kwietnia), stając się pierwszym klubem piłkarskim w prowincji Alajuela. Swój pierwszy mecz nowy klub rozegrał 2 sierpnia 1919 roku w Cartago, gdzie Alajuelense odniósł nad miejscowym klubem Club Sport Cartaginés zwycięstwo w stosunku 3:1.