W 1990 roku, w wyniku zachodzących zmian na bazie zakładu o nazwie Ośrodek Badawczy Elektroniki i Automatyki Górniczej w Katowicach, zarządzeniem Ministra Przemysłu utworzono Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Elektrotechniki i Automatyki Górniczej EMAG, który w 1992 roku zmienił nazwę na Centrum Elektryfikacji i Automatyzacji Górnictwa EMAG.

Już w ciągu niespełna kilkunastu lat od utworzenia osiągnął pozycję znaczącego i cenionego ośrodka naukowo-badawczego, zwłaszcza w obszarach automatyki przemysłowej, systemów bezpieczeństwa i monitorowania zagrożeń naturalnych oraz aparatury. 1 stycznia 2007 roku w wyniku konsolidacji polskich jednostek badawczo-rozwojowych do Centrum EMAG zostały włączone: Instytut Systemów Sterowania (ISS) oraz Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Gospodarki Energetycznej (OBRGE). Od tego czasu rozwijana była działalność w obszarze informatyki stosowanej..

We wrześniu 2009 r. jednostka zmieniła nazwę na Instytut Technik Innowacyjnych EMAG.

Z początkiem 2016 r., zmianie uległ organ nadzorujący instytut z Ministra Gospodarki na Ministra Cyfryzacji.