3 września wieczorem Opalenicki batalion ON na rozkaz przełożonych podjął odwrót przez Kobylepole, Neklę, Powidz omijając Wrześnię bombardowaną przez lotnictwo niemieckie. Szpicę przednią stanowił I pluton 3 kompanii ON, straż tylną III pluton 2 kompanii ON. Od 6 września batalion został skierowany rozkazem płk. Siudy z rejonu Powidza przez Anastazewo, Budzisław Kościelny, Ościsłowo, Starą Rudę do rejonu Skulska, gdzie zamknął swoimi pododdziałami przejścia pomiędzy jeziorami Skulskim a Ślesińskim. Dowództwo batalionu kwaterowało w Starej Rudzie. Od 8 września batalion został przegrupowany, zajął stanowiska obronne na rubieży Gawrony-jezioro Panajewskie-folwark Buszkowo-Jezioro Głębockie-Szyszyn-Bolesławowo. Dokonano spiętrzeń wody na kanałach i Noteci.
Został podporządkowany początkowo dowódcy improwizowanego pułku ON, ppłk dypl. Franciszkowi Junkerowi. Oddział ten występował pod nazwą Zgrupowanie Obrony Narodowej „Rudzica” i wchodził w skład Zgrupowania płk. Stanisława Siudy. Od 9 września batalion wchodził w skład 1 pułku ON „Poznań”.