Batalion stacjonował w Kole i organizował obronę miasta. Krotoszyński batalion ON w składzie 3 pułku ON prowadził działania obronne i opóźniające. W godzinach wieczornych 15 września wraz z pułkiem opuścił zajmowany odcinek obrony w rejonie Długołęki i marszem ubezpieczonym skierował się w kierunku Gąbina. Rano 16 września batalion dotarł do Gąbina i zajął stanowiska obronne. Na batalion i cały 3 pułk ON nieprzyjaciel skierował ataki lotnictwa i ostrzał artylerii. Batalion wraz pułkiem poniósł ciężkie straty osobowe i materiałowe. Poszczególne bataliony 3 pułku ON przedzierały się nocą 16/17 września w kierunku Bzury samodzielnie. We wczesnych godzinach porannych 17 września batalion w rejonie Iłowa został zaatakowany przez lotnictwo niemieckie. W wyniku wielogodzinnego nalotu wielu żołnierzy poległo lub zostało rannych. 18 września większość żołnierzy dostała się do niemieckiej niewoli, nieliczni którzy przeprawili się przez Bzurę, po walce 19 września również ci żołnierze zostali okrążeni i zostali wzięci do niewoli. Organizacja i obsada personalna Dowództwo batalionu i pododdziałów: dowódca batalionu – kpt. Adolf Jusof adiutant batalionu – ppor. rez. Tadeusz Mieczysław Tułaj dowódca plutonu zwiadu – ppor. rez. Eugeniusz Leszczyński dowódca plutonu ppanc. – por. rez.