Raio Piiroja (ur. 11 lipca 1979 w Pärnu), piłkarz estoński grający na pozycji środkowego obrońcy.
Kariera klubowa Piiroja jest wychowankiem klubu Tervis Pärnu, pochodzącego z jego rodzinnej miejscowości Pärnu. W jego barwach zadebiutował już w 1995 roku w lidze, w wieku 16 lat. W 1997 roku Piiroja przeszedł do Lelle SK, w którym spędził kolejne 2,5 roku piłkarskiej kariery. W 1999 roku w trakcie sezonu przeszedł do Flory Tallinn, jednego z czołowych klubów kraju. Tam szybko wywalczył miejsce na środku obrony w wyjściowej jedenastce i w kolejnych sezonach stał się jednym z najlepszych obrońców ligi estońskiej. Pierwszy sukces z Florą osiągnął w 2001 roku, gdy wywalczył mistrzostwo Estonii. W 2002 roku powtórzył to osiągnięcie i dodatkowo uznano go Piłkarzem Roku w Estonii.