Historia Imperial College był częścią Uniwersytetu Londyńskiego do roku 2007, kiedy to uzyskał pełną niezależność, z okazji stulecia swego istnienia. Imperial College London powstał w 1907 roku z połączenia Royal College of Science, City and Guilds College i Royal School of Mines. W roku 1988 do Imperial College London przyłączyła się St Mary's Hospital Medical School, a w 1995 National Heart and Lung Institute. W 1997 przyłączyły się Charing Cross and Westminster Medical School oraz Royal Postgraduate Medical School. W 2000 przyłączyły się Wye College oraz The Kennedy Institute of Rheumatology.
Współcześnie Oprócz wydziałów politechnicznych, uczelnia ma w swoim składzie kilka instytucji, zajmujących się kształceniem lekarzy i badaniami medycznymi, które zostały wydzielone z Uniwersytetu Londyńskiego. Są to: St Mary's Hospital Medical School, The National Heart and Lung Institute, Charing Cross and Westminster Medical School, The Royal Postgraduate Medical School, dawny Wye College (po zmianie: Imperial College at Wye), The Kennedy Institute of Rheumatology.