Zdołał jednak zdobyć 5 goli w 15 meczach i zostać drugi raz w karierze mistrzem kraju. Z czasem jednak de Jong zaczynał przeżywać prawdziwy dramat. Przez dwa sezony (2005/2006 oraz 2006/2007) nie wystąpił w żadnym oficjalnym meczu PSV ciągle lecząc kontuzje kolana oraz łydki. W sezonie 2006/2007 zagrał 5 spotkań w rezerwach, a rozmowy z Ronaldem Koemanem dały rezultat nowego kontraktu.
Z powodu ciągnącej się walki z kontuzją kolana de Jong dnia 26 lutego 2008 zakończył sportową karierę.
Sezon Klub Kraj Rozgrywki Mecze Bramki 1995/96 FC Den Haag
Eerste divisie 30 6 1996/97 ADO Den Haag
Eerste divisie 24 4 1997/98 ADO Den Haag
Eerste divisie 15 9 1997/98 FC Utrecht
Eredivisie 14 3 1998/99 FC Utrecht
Eredivisie 33 8 1999/00 FC Utrecht
Eredivisie 24 5 2000/01 PSV Eindhoven
Eredivisie 28 3 2001/02 FC Utrecht
Eredivisie 20 2 2002/03 SC Heerenveen
Eredivisie 26 9 2003/04 PSV Eindhoven
Eredivisie 29 8 2004/05 PSV Eindhoven
Eredivisie 15 5 2005/06 PSV Eindhoven
Eredivisie 0 0 2006/07 PSV Eindhoven
Eredivisie 0 0 Łącznie w Eredivisie 189 43