187, The Village VoiceA−Robert Christgau "Christgau's Consumer Guide", The Village Voice, 28 stycznia 1986 Choć album nie osiągnął wśród fanów takiego statusu jak Zen Arcade i New Day Rising, otrzymał pozytywne opinie krytyków. Dziennikarz The Village Voice, Robert Christgau stwierdził, że „Zespół nigdy nie brzmiał tak dobrze”. Ira Robbins i John Leland w magazynie Trouser Press wyrazili opinię: „Zdecydowanie genialny - czternaście niezapomnianych popowych melodii, granych jakby armagedon był blisko"John Leland, Ira Robbins "Hüsker Dü", Trouser Press. Stephen Thomas Erlewine z AllMusic napisał, że „Flip Your Wig byłby znakomitym albumem na własnych warunkach, ale fakt, że został wydany kilka miesięcy po New Day Rising i nieco ponad rok po Zen Arcade jest wprost zdumiewający”.
Dziedzictwo Na kilka dekad po wydaniu płyty, wokalista i gitarzysta zespołu, Bob Mould nazwał Flip Your Wig „najlepszym albumem jaki kiedykolwiek nagrało Hüsker Dü”Mould 2011, s. 103. W 2004 roku grupa Poster Children nagrała własną wersję „Divide and Conquer„”"Divide and Conquer by Hüsker Dü", WhoSampled. Utwór „Makes No Sense at All” został wykonany w 1994 przez zespół Balance oraz przez samego członka Hüsker Dü, Boba Moulda"Makes No Sense at All by Hüsker Dü", WhoSampled.