Wersja stworzona w 1997 roku była przeznaczona do rywalizacji w ówczesnych wyścigach serii FIA GT. Początkowo przegrywając walkę z McLarenami, w drugiej części sezonu Mercedesy wyszły na prowadzenie i ostatecznie zwyciężyły, zarówno w kategorii zespołu, jak i pojedynczego pojazdu (mistrzem został Bernd Schneider). W 1998 roku Mercedes CLK GTR oficjalnie wystartował w dwóch pierwszych wyścigach serii, po czym skupił się na długodystansowym wyścigu 24h Le Mans. Zmodernizowany, przygotowany pod kilkakrotnie dłuższą rywalizację model oznaczono jako Mercedes CLK LM. Zmiany (głównie silniki) nie sprawdziły się - oba CLK LM odpadły z wyścigu w pierwszych jego godzinach.

Jednak w wyścigach średniego dystansu zastąpienie modeli CLK GTR przez CLK LM poskutkowało miażdżącym zwycięstwem Mercedesa w FIA GT w roku 1998. W 1999 roku, wskutek braku konkurentów dla modelu CLK LM, kategoria GT1 została zlikwidowana.