Utworzono akademię wojskową z 320 kadetami w wieku od 18 do 25 lat, z zamiarem stworzenia nowej klasy oficerskiej, „nieskażonej” wcześniejszą służbą w Narodowej Armii Rewolucyjnej i całkowicie lojalnej wobec Rządu Reformowanego. Roczny kurs szkoleniowy prowadzili japońscy oficerowie. Jednak szkolenie zostało przerwane, ponieważ rozbudowana armia, która w listopadzie 1939 roku liczyła 30 000 ludzi, potrzebowała zbyt wielu oficerów. Jakość tej armii była bardzo niska, ponieważ raporty wskazywały, że żołnierze Rządu Reformowanego uciekali przed partyzantami, z którymi mieli walczyć.
Armia Rządu Reformowanego początkowo była zorganizowana w następujący sposób: 1 Okręg Pacyfikacyjny – prowincje Zhejiang i Jiangxi 2., 3. i 4 Okręg Pacyfikacyjny – regiony na południe od rzeki Jangcy 5 Okręg Pacyfikacyjny – regiony na północ od rzeki Jangcy.