Od roku 1949 do 1969 prowadził własne przedsiębiorstwo Zuse KG.
Maszyny Zusego Konstrukcje Zusego: Z1, Z2 i Z3 nosiły początkowo nazwy V1, V2 i V3 (Versuchsmodell – model eksperymentalny); zmienił ten kryptonim, by nie popaść w kolizję z nazwami niemieckich broni V. Oryginalne egzemplarze tych maszyn uległy zniszczeniu w trakcie wojny. Maszyna Z4 (konstruowana w latach 1942–1945), częściowo zachowana po wojnie, została skompletowana i uruchomiona w 1950 roku na politechnice Eidgenössische Technische Hochschule (ETHZ) w Zurychu w Szwajcarii. Była używana do obliczeń naukowych. Kolejna konstrukcja, Z5, posłużyła do obliczeń w dziedzinie optyki dla przedsiębiorstwa Leitz.
Zuse KG Przedsiębiorstwo Zusego, Zuse KG, skonstruowało i wyprodukowało kilka modeli komputerów, w tym przekaźnikowy Z11, lampowy Z22, tranzystorowy Z23. Zuse KG stała się częścią koncernu Siemens AG w roku 1969.
Odznaczenia i wyróżnienia Otrzymał wiele nagród i wyróżnień, m.in. osiem doktoratów h.c., dwa tytuły honorowego profesora (od uniwersytetów w Getyndze i Szczecinie).
Otrzymał też: Werner von Siemens-Ring (1964) Harry H.