W studiach uwzględnia się przede wszystkim elementy historii idei, dzieje przemian w strukturze warstw i grup społecznych, genezę i historię systemów totalitarnych oraz badania nad imperiami
Badania nad dziejami regionów Badania nad dziejami europejskich regionów historyczno-geograficznych uwzględniają przede wszystkim studia nad historią: Niemiec (Brandenburgia i Prusy) Czech i Słowacji Rosji, ZSRR i Federacji Rosyjskiej oraz b. republik wchodzących w skład ZSRR krajów bałtyckich, a zwłaszcza Litwy krajów bałkańskich.
Główne prace dokumentacyjne Główne prace dokumentacyjne Instytutu Historii PAN dotyczą: edycji źródeł historycznych redakcji Polskiego Słownika Biograficznego
Bibliografii retrospektywnej wydawnictw XIX i XX w. Słownika historyczno-geograficznego ziem polskich w średniowieczu Atlas historii Polski.