Lata 60. i 70. Grający w sezonie 1962/63 w III lidze TKS Rapid-Orzeł Wełnowiec uzyskał awans na drugi poziom rozgrywek ligowych. Od rundy wiosennej sezonu 1963/64 II ligi, wobec utworzenia GKS, zespół ten występował pod nową nazwą. W kolejnym sezonie uzyskał GKS awansował do najwyższej klasy rozgrywkowej. Od sezonu 1965/66 do 1970/71 klub występował w I lidze (do 2008 roku była to najwyższa klasa rozgrywkowa). W 1968 GKS Katowice wchłonął założony w 1922 Dąb Katowice. GKS Katowice grał w II lidze do sezonu 1977/78, po czym ponownie awansował do najwyższej klasy rozgrywkowej, w której występował przez kolejne dwa sezony.
Lata 80. i 90. W latach 80. i 90. XX w. GKS zdobył najwięcej trofeów i tytułów. Sezon 1980/81 i 1981/82 zespół spędził na zapleczu najwyższej klasy rozgrywkowej. Na pierwszy sukces drużyna czekała do 1985, kiedy dotarła do finału Pucharu Polski. Katowiccy piłkarze ulegli wtedy w rzutach karnych Widzewowi Łódź 1:3.
Pierwsze trofeum klub zdobył w następnym sezonie. Na drodze do triumfu w Pucharze Polski stanął tym razem Górnik Zabrze, lecz GKS Katowice pokonał rywala 4:1 po hat tricku Jana Furtoka. Po Puchar Polski katowicki klub sięgał jeszcze w sezonie 1990/91 i 1992/93, po zwycięstwa odpowiednio nad Legią Warszawa i Ruchem II Chorzów.