Wykonano ją z czerwonego marmuru, neogotyckie obramienie wykonano z czarnego dębnickiego „marmuru”. Nagrobek ten został znaleziony w 1828 w Pałacu Spiskim w Krakowie i przeniesiony do kościoła w Krzeszowicach w 1851. W kaplicy po lewej stronie umieszczono obraz przedstawiający św. Marcina z Tours oddającego połowę swojego płaszcza żebrakowi. Obraz ten namalował Franciszek Paszkowski w latach 1843–1845. W ścianie tej kaplicy znajduje się wmurowany kamień pochodzący z grobu św. Marcina z Tours.
Posadzka w kościele wykonana została z płytek kamiennych ułożonych rombowo w czarno-białą szachownicę. Witraże i polichromię kościoła wykonali Julian Krupski oraz Bolesław Szpecht.
W 1908 w kościele pochowano Andrzeja Potockiego. W podziemiu znajduje się nekropolia z grobami 15 przedstawicieli krzeszowickiej linii Potockich, m.in. Katarzyny Potockiej (1825–1907), Artura Władysława Potockiego (1850-1890), Adama Józefa Potockiego (1822-1872), oraz Róży z Potockich Branickiej (1782-1862), teściowej Zygmunta Krasińskiego.