Struktura organizacyjna Najwyższą władzą ETSI wyznaczającą jego ogólną politykę oraz podejmującą organizacyjne i strategiczne decyzje jest Zgromadzenie Ogólne (General Assembly – GA). Składa się ono z przedstawicieli członków pełnych, stowarzyszonych i obserwatorów, a także doradców, będących przedstawicielami Komisji Europejskiej i sekretariatu EFTA. Na posiedzeniach Zgromadzenia Ogólnego prawo do głosowania we wszystkich kwestiach mają jedynie członkowie pełni. Zgromadzenia Ogólne odbywają się dwa razy do roku.

W imieniu Zgromadzenia Ogólnego między jego posiedzeniami działa Rada (ETSI Board). Sprawuje ona funkcje powierzone jej przez Zgromadzenie Ogólne i przed nim odpowiada za swoją działalność. W skład Rady wchodzi zwykle od 15 do 30 przedstawicieli pełnych członków ETSI, którzy są wybierani większością głosów wyłącznie przez pełnych członków ETSI. przy radzie działa Sekretariat. W strukturze ETSI znajduje się także Organizacja Techniczna. W skład Organizacji Technicznej wchodzą; Technical Committees (TCs), ETSI Projects (EPs), ETSI Partnership Projests (EPPs). W strukturze ETSI znajdują się także komitety specjalne (Special Committees).