W 1996 producentem programu została spółka MKS, utworzona przez Marka Sella. Powstała strona internetowa programu oraz BBS. Spółka kontynuowała rozwój programu po śmierci jego autora w 2004. Powstały wersje dla systemu Microsoft Windows oraz Unix. Firma udostępniła także skaner on-line na swojej stronie www, oparty na technologii ActiveX.
Po ogłoszeniu upadłości MKS syndyk sprzedał w roku 2011 prawa do znaku mks_vir firmie ArcaBit Sp. z o.o., utworzonej kilka lat wcześniej przez byłych pracowników MKS, która reaktywowała produkt mks_vir w postaci darmowej aplikacji antywirusowej.
Oficjalnie ArcaBit wycofała się z dystrybucji i wsparcia programu w dniu 1 marca 2014.
Od maja 2018 roku mks_vir jest ponownie dostępny wraz z nowym logotypem, nową szatą graficzną i nową stroną www.