We wrześniu 1986 roku szkoła przeniosła swoją siedzibę do budynku na osiedlu Tysiąclecia (Dolnym) przy alei Bolesława Krzywoustego 9, który do tej pory zajmowała Szkoła Podstawowa nr 63 w Katowicach. Sama zaś szkoła podstawowa przeprowadziła się do budynku przy ulicy Bolesława Chrobrego 4. W roku szkolnym 1986/1987 utworzono w liceum klasę eksperymentalną, w której naukę rozpoczęła 30-osobowa, uzdolniona matematycznie grupa uczniów klasy VI. W klasie tej realizowano rozszerzony program nauczania matematyki i fizyki.
W latach 1990–1995 szkoła nie miała swojego patrona, zaś w dniu 4 września 1995 roku na mocy uchwały Rady Miejskiej Katowic nadano szkole imię Henryka Sienkiewicza. W marcu 1995 roku nastąpiło uroczyste otwarcie czytelni. 2 kwietnia 1996 roku gościem IX Liceum Ogólnokształcącego był wnuk patrona szkoły, Juliusz Sienkiewicz. Odwiedził on ponownie szkołę rok później. 12 lutego 2004 roku w budynku IX Liceum Ogólnokształcącego odbyło się uroczyste otwarcie nowej pracowni komputerowej, w której udział brali m.in.