dwunastkę (o godzinie 12:00), mszę z „kazaniem filozoficznym”, na której gromadziły się tłumy krakowian.
Od 2014 do 2023 w niedzielne poranki w audycji Pejzaże regionalne, nadawanej na antenie Radia Kraków były emitowane jego felietony w cyklu Prawdy nieoczywiste. Poruszał w nich głównie tematy religijne, filozoficzne i społeczne.
We wrześniu 2014, generał zakonu, o. Bruno Cadoré, przyznał o. Janowi Andrzejowi Kłoczowskiemu tytuł mistrza świętej teologii, najwyższy dominikański tytuł naukowy. Uroczystość nadania tytułu odbyła się 14 listopada tegoż roku w krakowskim klasztorze dominikanów. Laudację wygłosili prof. Władysław Stróżewski, prof. Karol Tarnowski oraz o. dr Damian Mrugalski.
Przez ostatnie miesiące życia cierpiał na chorobę Alzheimera.
Został pochowany 16 kwietnia 2025 na cmentarzu Rakowickim w Krakowie.
Publikacje Jest autorem licznych prac z dziedziny filozofii, religii i teologii, m.in.: Człowiek – bogiem człowieka: filozoficzny kontekst rozumienia religii w „Istocie chrześcijaństwa” Ludwika Feuerbacha, Lublin: Katolicki Uniwersytet Lubelski, 1979 A myśmy się spodziewali..., Poznań: „W Drodze”, 1990, . Więcej niż mit: Leszka Kołakowskiego spory o religię, Kraków: Znak, 1994, . Drogi człowieka mistycznego, Kraków, Wyd.